Іноді військово-лікарські комісії виносять рішення, які, на думку військовослужбовців, не відображають їхній реальний стан здоров'я. У таких випадках, згідно з інформацією, наданою пресслужбою Міністерства охорони здоров'я, військовослужбовці мають право оскаржити ці рішення в досудовому порядку або в суді.
Щоб оскаржити рішення ВЛК у досудовому порядку військовослужбовець має:
Відповідно до процедур, комісія може переглянути оскаржувальну постанову й направити особу на повторний медичний огляд та дообстеження.
Оскаржити рішення ВЛК в суді можна у порядку адміністративного судочинства, дотримуючись вимог Кодексу адміністративного судочинства України. Важливо зауважити, що суд може розглядати оскарження порушень процедури проведення ВЛК та скасовувати її рішення. Суд також може зобов'язати ВЛК провести повторний медичний огляд та дообстеження військовослужбовця у разі відмови комісії це зробити.